docomoの利用請求で、iTuneで6000円と書いてあるのですが実際私は課金で3千円しか使ってま

＞ドコモは、Apple社から債権譲渡されたものを、Apple社にかわり請求しているのに過ぎない。
ぱっと見では分かりにくいかもしれないけど・・・

＞請求書にはiTuneのところに4月分と書いてあったのですが‥
docomoが請求しているのは、「4月に（Appleから）請求があった分」。
いつ使った分なのか？は、質問者サマとAppleの間の問題。

＞請求書にはiTuneのところに4月分と書いてあったのですが‥

その表記については、ドコモに確認するしかないところもある。
Appleで3月に課金したとしても、ドコモにしたら、4月になりApple社から債権譲渡されたから、4月分と表記している可能性もありますからね。

Apple社にお問い合わせ下さい。
ドコモは、Apple社から債権譲渡されたものを、Apple社にかわり請求しているのに過ぎない。

先々月が6000円とかってない？
債権譲渡だから、1ヶ月程度遅れて請求があがってくることがあるよ。

iTunesが請求してきているので、
Appleに問い合わせるしかないです。